Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms