Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL3P10147 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL3P10147 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL3P10147 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL3P10147 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL3P10147 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL3P10147 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL3P10147 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL3P10147 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL3P10147 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL3P10147 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL3P10147 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL3P10147 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL3P10147 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL3P10147 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL3P10147 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL3P10147 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL3P10147 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL3P10147 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL3P10147 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL3P10147 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL3P10147 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL3P10147 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL3P10147 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL3P10147 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL3P10147 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL3P10147 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL3P10147 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL3P10147 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL3P10147 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL3P10147 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL3P10147 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL3P10147 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL3P10147 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL3P10147 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL3P10147 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL3P10147 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL3P10147 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL3P10147 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL3P10147 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL3P10147 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL3P10147 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL3P10147 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL3P10147 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL3P10147 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL3P10147 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL3P10147 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL3P10147 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL3P10147 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL3P10147 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL3P10147 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL3P10147 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL3P10147 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL3P10147 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL3P10147 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL3P10147 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL3P10147 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL3P10147 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL3P10147 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL3P10147 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL3P10147 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL3P10147 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL3P10147 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL3P10147 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL3P10147 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL3P10147 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL3P10147 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL3P10147 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL3P10147 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL3P10147 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL3P10147 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL3P10147 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL3P10147 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL3P10147 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL3P10147 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL3P10147 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL3P10147 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL3P10147 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL3P10147 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL3P10147 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL3P10147 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL3P10147 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL3P10147 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL3P10147 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL3P10147 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL3P10147 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL3P10147 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL3P10147 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL3P10147 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL3P10147 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL3P10147 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL3P10147 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL3P10147 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL3P10147 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL3P10147 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL3P10147 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL3P10147 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL3P10147 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL3P10147 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL3P10147 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms