Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCATO75600 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCATO75600 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCATO75600 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GCATO75600 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCATO75600 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCATO75600 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCATO75600 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCATO75600 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCATO75600 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCATO75600 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCATO75600 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCATO75600 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCATO75600 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GCATO75600 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCATO75600 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCATO75600 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GCATO75600 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCATO75600 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCATO75600 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCATO75600 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCATO75600 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCATO75600 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCATO75600 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCATO75600 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCATO75600 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCATO75600 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCATO75600 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCATO75600 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCATO75600 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCATO75600 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCATO75600 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GCATO75600 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCATO75600 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GCATO75600 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCATO75600 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCATO75600 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCATO75600 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCATO75600 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCATO75600 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCATO75600 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCATO75600 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCATO75600 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCATO75600 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCATO75600 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCATO75600 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCATO75600 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCATO75600 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCATO75600 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCATO75600 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCATO75600 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCATO75600 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCATO75600 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCATO75600 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GCATO75600 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCATO75600 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCATO75600 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCATO75600 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GCATO75600 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCATO75600 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCATO75600 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCATO75600 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCATO75600 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCATO75600 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCATO75600 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCATO75600 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCATO75600 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCATO75600 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCATO75600 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms