Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPAG9O60271 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPAG9O60271 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms