Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDIL3O43854 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EDIL3O43854 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.19
EDIL3O43854 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDIL3O43854 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDIL3O43854 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDIL3O43854 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDIL3O43854 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EDIL3O43854 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDIL3O43854 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDIL3O43854 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDIL3O43854 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDIL3O43854 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms