Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRRTM2O43300 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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