Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VGFO15240 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VGFO15240 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VGFO15240 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VGFO15240 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VGFO15240 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VGFO15240 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VGFO15240 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
VGFO15240 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VGFO15240 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VGFO15240 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VGFO15240 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VGFO15240 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VGFO15240 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VGFO15240 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VGFO15240 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VGFO15240 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VGFO15240 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VGFO15240 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VGFO15240 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VGFO15240 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VGFO15240 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VGFO15240 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VGFO15240 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VGFO15240 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
VGFO15240 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
VGFO15240 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VGFO15240 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VGFO15240 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VGFO15240 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VGFO15240 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VGFO15240 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VGFO15240 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VGFO15240 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VGFO15240 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VGFO15240 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VGFO15240 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VGFO15240 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
VGFO15240 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VGFO15240 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VGFO15240 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VGFO15240 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VGFO15240 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
VGFO15240 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VGFO15240 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VGFO15240 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VGFO15240 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VGFO15240 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
VGFO15240 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
VGFO15240 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VGFO15240 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VGFO15240 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VGFO15240 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VGFO15240 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VGFO15240 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VGFO15240 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VGFO15240 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VGFO15240 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VGFO15240 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VGFO15240 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VGFO15240 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VGFO15240 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VGFO15240 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VGFO15240 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VGFO15240 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VGFO15240 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VGFO15240 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
VGFO15240 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VGFO15240 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
VGFO15240 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
VGFO15240 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VGFO15240 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VGFO15240 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
VGFO15240 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VGFO15240 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VGFO15240 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VGFO15240 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VGFO15240 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VGFO15240 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
VGFO15240 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VGFO15240 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VGFO15240 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VGFO15240 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VGFO15240 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VGFO15240 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VGFO15240 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VGFO15240 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VGFO15240 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VGFO15240 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VGFO15240 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VGFO15240 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
VGFO15240 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VGFO15240 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VGFO15240 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VGFO15240 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
VGFO15240 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VGFO15240 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VGFO15240 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VGFO15240 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGFO15240 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
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