Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLGNO14967 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLGNO14967 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLGNO14967 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLGNO14967 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLGNO14967 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLGNO14967 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLGNO14967 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLGNO14967 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLGNO14967 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLGNO14967 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLGNO14967 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLGNO14967 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLGNO14967 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLGNO14967 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLGNO14967 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CLGNO14967 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLGNO14967 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLGNO14967 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLGNO14967 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLGNO14967 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLGNO14967 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLGNO14967 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLGNO14967 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLGNO14967 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLGNO14967 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLGNO14967 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLGNO14967 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLGNO14967 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLGNO14967 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLGNO14967 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLGNO14967 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLGNO14967 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLGNO14967 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLGNO14967 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLGNO14967 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLGNO14967 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLGNO14967 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLGNO14967 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLGNO14967 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLGNO14967 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLGNO14967 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLGNO14967 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLGNO14967 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLGNO14967 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLGNO14967 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLGNO14967 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLGNO14967 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLGNO14967 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLGNO14967 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLGNO14967 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLGNO14967 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLGNO14967 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLGNO14967 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLGNO14967 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLGNO14967 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLGNO14967 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLGNO14967 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLGNO14967 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLGNO14967 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLGNO14967 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CLGNO14967 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLGNO14967 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLGNO14967 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLGNO14967 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLGNO14967 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLGNO14967 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLGNO14967 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLGNO14967 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLGNO14967 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLGNO14967 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CLGNO14967 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLGNO14967 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLGNO14967 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLGNO14967 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLGNO14967 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLGNO14967 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLGNO14967 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLGNO14967 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLGNO14967 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLGNO14967 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLGNO14967 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLGNO14967 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLGNO14967 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLGNO14967 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLGNO14967 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLGNO14967 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLGNO14967 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLGNO14967 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms