Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms