Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L11C9JVI0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms