Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX1

FAM223B, Protein FAM223B, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM223BA6NKX1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms