Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB19A4D1S5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms