Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms