Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M6

Cd97, CD97 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd97Q9Z0M6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cd97Q9Z0M6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cd97Q9Z0M6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cd97Q9Z0M6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cd97Q9Z0M6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cd97Q9Z0M6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cd97Q9Z0M6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cd97Q9Z0M6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cd97Q9Z0M6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cd97Q9Z0M6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cd97Q9Z0M6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cd97Q9Z0M6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cd97Q9Z0M6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Cd97Q9Z0M6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cd97Q9Z0M6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cd97Q9Z0M6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cd97Q9Z0M6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cd97Q9Z0M6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cd97Q9Z0M6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cd97Q9Z0M6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cd97Q9Z0M6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cd97Q9Z0M6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cd97Q9Z0M6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cd97Q9Z0M6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cd97Q9Z0M6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cd97Q9Z0M6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cd97Q9Z0M6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cd97Q9Z0M6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cd97Q9Z0M6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cd97Q9Z0M6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cd97Q9Z0M6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cd97Q9Z0M6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cd97Q9Z0M6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cd97Q9Z0M6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cd97Q9Z0M6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cd97Q9Z0M6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cd97Q9Z0M6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cd97Q9Z0M6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cd97Q9Z0M6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cd97Q9Z0M6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cd97Q9Z0M6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cd97Q9Z0M6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cd97Q9Z0M6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cd97Q9Z0M6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cd97Q9Z0M6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cd97Q9Z0M6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cd97Q9Z0M6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cd97Q9Z0M6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cd97Q9Z0M6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cd97Q9Z0M6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cd97Q9Z0M6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cd97Q9Z0M6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cd97Q9Z0M6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cd97Q9Z0M6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cd97Q9Z0M6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cd97Q9Z0M6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cd97Q9Z0M6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cd97Q9Z0M6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cd97Q9Z0M6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cd97Q9Z0M6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cd97Q9Z0M6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cd97Q9Z0M6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cd97Q9Z0M6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cd97Q9Z0M6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cd97Q9Z0M6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cd97Q9Z0M6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cd97Q9Z0M6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cd97Q9Z0M6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cd97Q9Z0M6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cd97Q9Z0M6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cd97Q9Z0M6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cd97Q9Z0M6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cd97Q9Z0M6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cd97Q9Z0M6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cd97Q9Z0M6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cd97Q9Z0M6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cd97Q9Z0M6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cd97Q9Z0M6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cd97Q9Z0M6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cd97Q9Z0M6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cd97Q9Z0M6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cd97Q9Z0M6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cd97Q9Z0M6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cd97Q9Z0M6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cd97Q9Z0M6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cd97Q9Z0M6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cd97Q9Z0M6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cd97Q9Z0M6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cd97Q9Z0M6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cd97Q9Z0M6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cd97Q9Z0M6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cd97Q9Z0M6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cd97Q9Z0M6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cd97Q9Z0M6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cd97Q9Z0M6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cd97Q9Z0M6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cd97Q9Z0M6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cd97Q9Z0M6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cd97Q9Z0M6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cd97Q9Z0M6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms