Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpv2Q9WTR1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpv2Q9WTR1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpv2Q9WTR1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpv2Q9WTR1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpv2Q9WTR1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpv2Q9WTR1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpv2Q9WTR1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpv2Q9WTR1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpv2Q9WTR1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpv2Q9WTR1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpv2Q9WTR1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpv2Q9WTR1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpv2Q9WTR1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpv2Q9WTR1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpv2Q9WTR1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpv2Q9WTR1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpv2Q9WTR1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpv2Q9WTR1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpv2Q9WTR1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpv2Q9WTR1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpv2Q9WTR1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpv2Q9WTR1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpv2Q9WTR1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpv2Q9WTR1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpv2Q9WTR1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpv2Q9WTR1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpv2Q9WTR1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpv2Q9WTR1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpv2Q9WTR1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpv2Q9WTR1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpv2Q9WTR1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpv2Q9WTR1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpv2Q9WTR1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpv2Q9WTR1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpv2Q9WTR1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpv2Q9WTR1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpv2Q9WTR1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpv2Q9WTR1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpv2Q9WTR1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpv2Q9WTR1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpv2Q9WTR1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpv2Q9WTR1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpv2Q9WTR1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpv2Q9WTR1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpv2Q9WTR1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpv2Q9WTR1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpv2Q9WTR1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpv2Q9WTR1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpv2Q9WTR1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpv2Q9WTR1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpv2Q9WTR1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpv2Q9WTR1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpv2Q9WTR1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpv2Q9WTR1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpv2Q9WTR1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpv2Q9WTR1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpv2Q9WTR1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpv2Q9WTR1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpv2Q9WTR1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpv2Q9WTR1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpv2Q9WTR1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpv2Q9WTR1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpv2Q9WTR1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpv2Q9WTR1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpv2Q9WTR1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpv2Q9WTR1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpv2Q9WTR1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpv2Q9WTR1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpv2Q9WTR1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpv2Q9WTR1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpv2Q9WTR1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trpv2Q9WTR1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trpv2Q9WTR1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trpv2Q9WTR1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpv2Q9WTR1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpv2Q9WTR1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpv2Q9WTR1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpv2Q9WTR1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpv2Q9WTR1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpv2Q9WTR1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpv2Q9WTR1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpv2Q9WTR1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpv2Q9WTR1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpv2Q9WTR1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpv2Q9WTR1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpv2Q9WTR1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpv2Q9WTR1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpv2Q9WTR1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpv2Q9WTR1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpv2Q9WTR1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpv2Q9WTR1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpv2Q9WTR1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpv2Q9WTR1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpv2Q9WTR1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpv2Q9WTR1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trpv2Q9WTR1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpv2Q9WTR1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpv2Q9WTR1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpv2Q9WTR1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms