Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrpxQ9R0M3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrpxQ9R0M3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SrpxQ9R0M3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrpxQ9R0M3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrpxQ9R0M3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrpxQ9R0M3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrpxQ9R0M3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrpxQ9R0M3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrpxQ9R0M3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrpxQ9R0M3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrpxQ9R0M3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrpxQ9R0M3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrpxQ9R0M3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrpxQ9R0M3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrpxQ9R0M3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrpxQ9R0M3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrpxQ9R0M3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SrpxQ9R0M3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SrpxQ9R0M3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrpxQ9R0M3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrpxQ9R0M3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrpxQ9R0M3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrpxQ9R0M3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SrpxQ9R0M3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrpxQ9R0M3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrpxQ9R0M3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrpxQ9R0M3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrpxQ9R0M3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrpxQ9R0M3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrpxQ9R0M3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrpxQ9R0M3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrpxQ9R0M3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrpxQ9R0M3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrpxQ9R0M3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrpxQ9R0M3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrpxQ9R0M3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrpxQ9R0M3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrpxQ9R0M3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SrpxQ9R0M3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SrpxQ9R0M3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SrpxQ9R0M3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrpxQ9R0M3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrpxQ9R0M3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrpxQ9R0M3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrpxQ9R0M3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrpxQ9R0M3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrpxQ9R0M3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrpxQ9R0M3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrpxQ9R0M3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrpxQ9R0M3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrpxQ9R0M3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrpxQ9R0M3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrpxQ9R0M3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrpxQ9R0M3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SrpxQ9R0M3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrpxQ9R0M3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrpxQ9R0M3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrpxQ9R0M3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrpxQ9R0M3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrpxQ9R0M3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrpxQ9R0M3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrpxQ9R0M3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrpxQ9R0M3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrpxQ9R0M3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrpxQ9R0M3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrpxQ9R0M3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrpxQ9R0M3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrpxQ9R0M3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrpxQ9R0M3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrpxQ9R0M3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrpxQ9R0M3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrpxQ9R0M3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms