Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ39

St6galnac1, Alpha-N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
St6galnac1Q9QZ39 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
St6galnac1Q9QZ39 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
St6galnac1Q9QZ39 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
St6galnac1Q9QZ39 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
St6galnac1Q9QZ39 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
St6galnac1Q9QZ39 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
St6galnac1Q9QZ39 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
St6galnac1Q9QZ39 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
St6galnac1Q9QZ39 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
St6galnac1Q9QZ39 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
St6galnac1Q9QZ39 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
St6galnac1Q9QZ39 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
St6galnac1Q9QZ39 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
St6galnac1Q9QZ39 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
St6galnac1Q9QZ39 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
St6galnac1Q9QZ39 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
St6galnac1Q9QZ39 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
St6galnac1Q9QZ39 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
St6galnac1Q9QZ39 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
St6galnac1Q9QZ39 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
St6galnac1Q9QZ39 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
St6galnac1Q9QZ39 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
St6galnac1Q9QZ39 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
St6galnac1Q9QZ39 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
St6galnac1Q9QZ39 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
St6galnac1Q9QZ39 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
St6galnac1Q9QZ39 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
St6galnac1Q9QZ39 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
St6galnac1Q9QZ39 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
St6galnac1Q9QZ39 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
St6galnac1Q9QZ39 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
St6galnac1Q9QZ39 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
St6galnac1Q9QZ39 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
St6galnac1Q9QZ39 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
St6galnac1Q9QZ39 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
St6galnac1Q9QZ39 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
St6galnac1Q9QZ39 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
St6galnac1Q9QZ39 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
St6galnac1Q9QZ39 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
St6galnac1Q9QZ39 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
St6galnac1Q9QZ39 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
St6galnac1Q9QZ39 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
St6galnac1Q9QZ39 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
St6galnac1Q9QZ39 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
St6galnac1Q9QZ39 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
St6galnac1Q9QZ39 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
St6galnac1Q9QZ39 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
St6galnac1Q9QZ39 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
St6galnac1Q9QZ39 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
St6galnac1Q9QZ39 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
St6galnac1Q9QZ39 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
St6galnac1Q9QZ39 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
St6galnac1Q9QZ39 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
St6galnac1Q9QZ39 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
St6galnac1Q9QZ39 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
St6galnac1Q9QZ39 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
St6galnac1Q9QZ39 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
St6galnac1Q9QZ39 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
St6galnac1Q9QZ39 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
St6galnac1Q9QZ39 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
St6galnac1Q9QZ39 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
St6galnac1Q9QZ39 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
St6galnac1Q9QZ39 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
St6galnac1Q9QZ39 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
St6galnac1Q9QZ39 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
St6galnac1Q9QZ39 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
St6galnac1Q9QZ39 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
St6galnac1Q9QZ39 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
St6galnac1Q9QZ39 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
St6galnac1Q9QZ39 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
St6galnac1Q9QZ39 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
St6galnac1Q9QZ39 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
St6galnac1Q9QZ39 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
St6galnac1Q9QZ39 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
St6galnac1Q9QZ39 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
St6galnac1Q9QZ39 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
St6galnac1Q9QZ39 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
St6galnac1Q9QZ39 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.5 ms