Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lmbr1Q9JIT0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Lmbr1Q9JIT0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lmbr1Q9JIT0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmbr1Q9JIT0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmbr1Q9JIT0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmbr1Q9JIT0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmbr1Q9JIT0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmbr1Q9JIT0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmbr1Q9JIT0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmbr1Q9JIT0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmbr1Q9JIT0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmbr1Q9JIT0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmbr1Q9JIT0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lmbr1Q9JIT0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmbr1Q9JIT0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmbr1Q9JIT0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmbr1Q9JIT0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmbr1Q9JIT0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmbr1Q9JIT0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmbr1Q9JIT0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmbr1Q9JIT0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Lmbr1Q9JIT0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lmbr1Q9JIT0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lmbr1Q9JIT0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lmbr1Q9JIT0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lmbr1Q9JIT0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmbr1Q9JIT0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmbr1Q9JIT0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmbr1Q9JIT0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lmbr1Q9JIT0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lmbr1Q9JIT0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmbr1Q9JIT0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lmbr1Q9JIT0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lmbr1Q9JIT0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lmbr1Q9JIT0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Lmbr1Q9JIT0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lmbr1Q9JIT0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lmbr1Q9JIT0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lmbr1Q9JIT0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Lmbr1Q9JIT0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lmbr1Q9JIT0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lmbr1Q9JIT0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lmbr1Q9JIT0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lmbr1Q9JIT0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lmbr1Q9JIT0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lmbr1Q9JIT0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lmbr1Q9JIT0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lmbr1Q9JIT0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lmbr1Q9JIT0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lmbr1Q9JIT0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lmbr1Q9JIT0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lmbr1Q9JIT0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lmbr1Q9JIT0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lmbr1Q9JIT0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lmbr1Q9JIT0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lmbr1Q9JIT0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lmbr1Q9JIT0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lmbr1Q9JIT0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lmbr1Q9JIT0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lmbr1Q9JIT0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Lmbr1Q9JIT0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lmbr1Q9JIT0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lmbr1Q9JIT0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lmbr1Q9JIT0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmbr1Q9JIT0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmbr1Q9JIT0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmbr1Q9JIT0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmbr1Q9JIT0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmbr1Q9JIT0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmbr1Q9JIT0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lmbr1Q9JIT0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lmbr1Q9JIT0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lmbr1Q9JIT0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmbr1Q9JIT0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmbr1Q9JIT0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmbr1Q9JIT0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmbr1Q9JIT0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmbr1Q9JIT0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Lmbr1Q9JIT0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lmbr1Q9JIT0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lmbr1Q9JIT0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lmbr1Q9JIT0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lmbr1Q9JIT0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lmbr1Q9JIT0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lmbr1Q9JIT0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lmbr1Q9JIT0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lmbr1Q9JIT0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lmbr1Q9JIT0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lmbr1Q9JIT0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lmbr1Q9JIT0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lmbr1Q9JIT0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lmbr1Q9JIT0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lmbr1Q9JIT0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lmbr1Q9JIT0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Lmbr1Q9JIT0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Lmbr1Q9JIT0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lmbr1Q9JIT0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lmbr1Q9JIT0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lmbr1Q9JIT0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms