Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI58

Raet1d, Retinoic acid early-inducible protein 1-delta, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raet1dQ9JI58 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Raet1dQ9JI58 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Raet1dQ9JI58 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Raet1dQ9JI58 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Raet1dQ9JI58 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Raet1dQ9JI58 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Raet1dQ9JI58 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Raet1dQ9JI58 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Raet1dQ9JI58 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Raet1dQ9JI58 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Raet1dQ9JI58 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Raet1dQ9JI58 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Raet1dQ9JI58 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Raet1dQ9JI58 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Raet1dQ9JI58 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Raet1dQ9JI58 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Raet1dQ9JI58 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Raet1dQ9JI58 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Raet1dQ9JI58 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Raet1dQ9JI58 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Raet1dQ9JI58 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Raet1dQ9JI58 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Raet1dQ9JI58 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Raet1dQ9JI58 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Raet1dQ9JI58 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Raet1dQ9JI58 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Raet1dQ9JI58 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Raet1dQ9JI58 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Raet1dQ9JI58 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Raet1dQ9JI58 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Raet1dQ9JI58 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Raet1dQ9JI58 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Raet1dQ9JI58 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Raet1dQ9JI58 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Raet1dQ9JI58 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Raet1dQ9JI58 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Raet1dQ9JI58 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Raet1dQ9JI58 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Raet1dQ9JI58 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Raet1dQ9JI58 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Raet1dQ9JI58 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Raet1dQ9JI58 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Raet1dQ9JI58 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Raet1dQ9JI58 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Raet1dQ9JI58 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Raet1dQ9JI58 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Raet1dQ9JI58 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Raet1dQ9JI58 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Raet1dQ9JI58 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Raet1dQ9JI58 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Raet1dQ9JI58 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Raet1dQ9JI58 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Raet1dQ9JI58 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Raet1dQ9JI58 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Raet1dQ9JI58 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Raet1dQ9JI58 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Raet1dQ9JI58 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Raet1dQ9JI58 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Raet1dQ9JI58 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Raet1dQ9JI58 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Raet1dQ9JI58 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Raet1dQ9JI58 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Raet1dQ9JI58 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Raet1dQ9JI58 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Raet1dQ9JI58 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Raet1dQ9JI58 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Raet1dQ9JI58 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Raet1dQ9JI58 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Raet1dQ9JI58 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Raet1dQ9JI58 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Raet1dQ9JI58 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Raet1dQ9JI58 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Raet1dQ9JI58 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Raet1dQ9JI58 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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