Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SyncQ9EPM5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SyncQ9EPM5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SyncQ9EPM5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SyncQ9EPM5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SyncQ9EPM5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SyncQ9EPM5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SyncQ9EPM5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SyncQ9EPM5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SyncQ9EPM5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SyncQ9EPM5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SyncQ9EPM5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SyncQ9EPM5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SyncQ9EPM5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SyncQ9EPM5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SyncQ9EPM5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SyncQ9EPM5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SyncQ9EPM5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SyncQ9EPM5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SyncQ9EPM5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SyncQ9EPM5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SyncQ9EPM5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SyncQ9EPM5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SyncQ9EPM5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SyncQ9EPM5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SyncQ9EPM5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SyncQ9EPM5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SyncQ9EPM5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SyncQ9EPM5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SyncQ9EPM5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SyncQ9EPM5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SyncQ9EPM5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SyncQ9EPM5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SyncQ9EPM5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SyncQ9EPM5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SyncQ9EPM5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SyncQ9EPM5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SyncQ9EPM5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SyncQ9EPM5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SyncQ9EPM5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SyncQ9EPM5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SyncQ9EPM5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SyncQ9EPM5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SyncQ9EPM5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SyncQ9EPM5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SyncQ9EPM5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SyncQ9EPM5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SyncQ9EPM5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SyncQ9EPM5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SyncQ9EPM5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SyncQ9EPM5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SyncQ9EPM5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SyncQ9EPM5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SyncQ9EPM5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SyncQ9EPM5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SyncQ9EPM5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SyncQ9EPM5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SyncQ9EPM5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SyncQ9EPM5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SyncQ9EPM5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SyncQ9EPM5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SyncQ9EPM5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SyncQ9EPM5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SyncQ9EPM5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SyncQ9EPM5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SyncQ9EPM5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SyncQ9EPM5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SyncQ9EPM5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SyncQ9EPM5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SyncQ9EPM5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SyncQ9EPM5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SyncQ9EPM5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SyncQ9EPM5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SyncQ9EPM5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SyncQ9EPM5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SyncQ9EPM5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SyncQ9EPM5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SyncQ9EPM5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SyncQ9EPM5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SyncQ9EPM5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SyncQ9EPM5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SyncQ9EPM5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SyncQ9EPM5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SyncQ9EPM5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SyncQ9EPM5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SyncQ9EPM5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SyncQ9EPM5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SyncQ9EPM5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SyncQ9EPM5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SyncQ9EPM5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SyncQ9EPM5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SyncQ9EPM5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SyncQ9EPM5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SyncQ9EPM5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SyncQ9EPM5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SyncQ9EPM5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SyncQ9EPM5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SyncQ9EPM5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SyncQ9EPM5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SyncQ9EPM5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms