Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mrpl4Q9DCU6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mrpl4Q9DCU6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mrpl4Q9DCU6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mrpl4Q9DCU6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mrpl4Q9DCU6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mrpl4Q9DCU6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mrpl4Q9DCU6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mrpl4Q9DCU6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mrpl4Q9DCU6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mrpl4Q9DCU6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mrpl4Q9DCU6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mrpl4Q9DCU6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mrpl4Q9DCU6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mrpl4Q9DCU6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mrpl4Q9DCU6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mrpl4Q9DCU6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mrpl4Q9DCU6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mrpl4Q9DCU6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mrpl4Q9DCU6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mrpl4Q9DCU6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mrpl4Q9DCU6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mrpl4Q9DCU6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mrpl4Q9DCU6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mrpl4Q9DCU6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Mrpl4Q9DCU6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mrpl4Q9DCU6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mrpl4Q9DCU6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mrpl4Q9DCU6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mrpl4Q9DCU6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mrpl4Q9DCU6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Mrpl4Q9DCU6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mrpl4Q9DCU6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mrpl4Q9DCU6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mrpl4Q9DCU6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mrpl4Q9DCU6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mrpl4Q9DCU6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mrpl4Q9DCU6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Mrpl4Q9DCU6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mrpl4Q9DCU6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mrpl4Q9DCU6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mrpl4Q9DCU6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mrpl4Q9DCU6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mrpl4Q9DCU6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mrpl4Q9DCU6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mrpl4Q9DCU6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mrpl4Q9DCU6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mrpl4Q9DCU6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mrpl4Q9DCU6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mrpl4Q9DCU6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mrpl4Q9DCU6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mrpl4Q9DCU6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mrpl4Q9DCU6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mrpl4Q9DCU6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mrpl4Q9DCU6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mrpl4Q9DCU6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mrpl4Q9DCU6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mrpl4Q9DCU6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mrpl4Q9DCU6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mrpl4Q9DCU6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mrpl4Q9DCU6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Mrpl4Q9DCU6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mrpl4Q9DCU6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mrpl4Q9DCU6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mrpl4Q9DCU6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mrpl4Q9DCU6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mrpl4Q9DCU6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mrpl4Q9DCU6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mrpl4Q9DCU6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mrpl4Q9DCU6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Mrpl4Q9DCU6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mrpl4Q9DCU6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mrpl4Q9DCU6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mrpl4Q9DCU6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mrpl4Q9DCU6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mrpl4Q9DCU6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mrpl4Q9DCU6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mrpl4Q9DCU6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Mrpl4Q9DCU6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mrpl4Q9DCU6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mrpl4Q9DCU6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mrpl4Q9DCU6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mrpl4Q9DCU6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mrpl4Q9DCU6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mrpl4Q9DCU6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mrpl4Q9DCU6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mrpl4Q9DCU6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mrpl4Q9DCU6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mrpl4Q9DCU6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mrpl4Q9DCU6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mrpl4Q9DCU6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mrpl4Q9DCU6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms