Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MNCb-2875Q9DCB3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MNCb-2875Q9DCB3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MNCb-2875Q9DCB3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MNCb-2875Q9DCB3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MNCb-2875Q9DCB3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MNCb-2875Q9DCB3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MNCb-2875Q9DCB3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MNCb-2875Q9DCB3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MNCb-2875Q9DCB3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MNCb-2875Q9DCB3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MNCb-2875Q9DCB3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MNCb-2875Q9DCB3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MNCb-2875Q9DCB3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MNCb-2875Q9DCB3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MNCb-2875Q9DCB3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MNCb-2875Q9DCB3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MNCb-2875Q9DCB3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MNCb-2875Q9DCB3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MNCb-2875Q9DCB3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MNCb-2875Q9DCB3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MNCb-2875Q9DCB3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MNCb-2875Q9DCB3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MNCb-2875Q9DCB3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MNCb-2875Q9DCB3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MNCb-2875Q9DCB3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MNCb-2875Q9DCB3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MNCb-2875Q9DCB3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MNCb-2875Q9DCB3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MNCb-2875Q9DCB3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MNCb-2875Q9DCB3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MNCb-2875Q9DCB3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MNCb-2875Q9DCB3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MNCb-2875Q9DCB3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MNCb-2875Q9DCB3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MNCb-2875Q9DCB3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MNCb-2875Q9DCB3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MNCb-2875Q9DCB3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MNCb-2875Q9DCB3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MNCb-2875Q9DCB3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MNCb-2875Q9DCB3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MNCb-2875Q9DCB3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MNCb-2875Q9DCB3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MNCb-2875Q9DCB3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MNCb-2875Q9DCB3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MNCb-2875Q9DCB3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MNCb-2875Q9DCB3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MNCb-2875Q9DCB3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MNCb-2875Q9DCB3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MNCb-2875Q9DCB3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MNCb-2875Q9DCB3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MNCb-2875Q9DCB3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MNCb-2875Q9DCB3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MNCb-2875Q9DCB3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MNCb-2875Q9DCB3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MNCb-2875Q9DCB3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms