Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cpne8Q9DC53 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cpne8Q9DC53 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cpne8Q9DC53 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cpne8Q9DC53 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cpne8Q9DC53 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cpne8Q9DC53 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cpne8Q9DC53 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cpne8Q9DC53 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cpne8Q9DC53 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cpne8Q9DC53 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cpne8Q9DC53 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cpne8Q9DC53 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cpne8Q9DC53 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpne8Q9DC53 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpne8Q9DC53 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpne8Q9DC53 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cpne8Q9DC53 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpne8Q9DC53 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpne8Q9DC53 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpne8Q9DC53 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpne8Q9DC53 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpne8Q9DC53 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpne8Q9DC53 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpne8Q9DC53 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpne8Q9DC53 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpne8Q9DC53 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpne8Q9DC53 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpne8Q9DC53 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpne8Q9DC53 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpne8Q9DC53 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpne8Q9DC53 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpne8Q9DC53 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpne8Q9DC53 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpne8Q9DC53 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpne8Q9DC53 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpne8Q9DC53 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpne8Q9DC53 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cpne8Q9DC53 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cpne8Q9DC53 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cpne8Q9DC53 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cpne8Q9DC53 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpne8Q9DC53 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpne8Q9DC53 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpne8Q9DC53 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpne8Q9DC53 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpne8Q9DC53 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpne8Q9DC53 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cpne8Q9DC53 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cpne8Q9DC53 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cpne8Q9DC53 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpne8Q9DC53 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpne8Q9DC53 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpne8Q9DC53 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpne8Q9DC53 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpne8Q9DC53 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpne8Q9DC53 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpne8Q9DC53 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cpne8Q9DC53 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cpne8Q9DC53 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpne8Q9DC53 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpne8Q9DC53 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpne8Q9DC53 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpne8Q9DC53 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpne8Q9DC53 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpne8Q9DC53 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpne8Q9DC53 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpne8Q9DC53 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpne8Q9DC53 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpne8Q9DC53 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpne8Q9DC53 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpne8Q9DC53 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpne8Q9DC53 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cpne8Q9DC53 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpne8Q9DC53 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms