Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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