Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB94

Wdr53, WD repeat-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr53Q9DB94 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdr53Q9DB94 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdr53Q9DB94 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdr53Q9DB94 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdr53Q9DB94 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdr53Q9DB94 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr53Q9DB94 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr53Q9DB94 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr53Q9DB94 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr53Q9DB94 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr53Q9DB94 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr53Q9DB94 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr53Q9DB94 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdr53Q9DB94 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdr53Q9DB94 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdr53Q9DB94 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdr53Q9DB94 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdr53Q9DB94 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdr53Q9DB94 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdr53Q9DB94 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr53Q9DB94 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdr53Q9DB94 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdr53Q9DB94 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdr53Q9DB94 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdr53Q9DB94 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdr53Q9DB94 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Wdr53Q9DB94 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdr53Q9DB94 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdr53Q9DB94 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wdr53Q9DB94 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Wdr53Q9DB94 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Wdr53Q9DB94 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Wdr53Q9DB94 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Wdr53Q9DB94 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Wdr53Q9DB94 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Wdr53Q9DB94 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Wdr53Q9DB94 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Wdr53Q9DB94 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Wdr53Q9DB94 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Wdr53Q9DB94 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Wdr53Q9DB94 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Wdr53Q9DB94 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Wdr53Q9DB94 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Wdr53Q9DB94 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Wdr53Q9DB94 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Wdr53Q9DB94 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Wdr53Q9DB94 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Wdr53Q9DB94 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Wdr53Q9DB94 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Wdr53Q9DB94 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr53Q9DB94 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr53Q9DB94 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr53Q9DB94 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr53Q9DB94 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr53Q9DB94 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr53Q9DB94 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr53Q9DB94 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr53Q9DB94 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr53Q9DB94 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr53Q9DB94 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr53Q9DB94 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr53Q9DB94 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr53Q9DB94 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr53Q9DB94 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr53Q9DB94 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr53Q9DB94 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr53Q9DB94 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr53Q9DB94 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr53Q9DB94 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr53Q9DB94 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Wdr53Q9DB94 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr53Q9DB94 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr53Q9DB94 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr53Q9DB94 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr53Q9DB94 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms