Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Actrt1Q9D9J3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actrt1Q9D9J3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actrt1Q9D9J3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actrt1Q9D9J3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actrt1Q9D9J3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actrt1Q9D9J3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actrt1Q9D9J3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actrt1Q9D9J3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actrt1Q9D9J3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actrt1Q9D9J3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actrt1Q9D9J3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actrt1Q9D9J3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actrt1Q9D9J3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Actrt1Q9D9J3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Actrt1Q9D9J3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Actrt1Q9D9J3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Actrt1Q9D9J3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Actrt1Q9D9J3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actrt1Q9D9J3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actrt1Q9D9J3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actrt1Q9D9J3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actrt1Q9D9J3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actrt1Q9D9J3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actrt1Q9D9J3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actrt1Q9D9J3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actrt1Q9D9J3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actrt1Q9D9J3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actrt1Q9D9J3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actrt1Q9D9J3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actrt1Q9D9J3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actrt1Q9D9J3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actrt1Q9D9J3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actrt1Q9D9J3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actrt1Q9D9J3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actrt1Q9D9J3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actrt1Q9D9J3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actrt1Q9D9J3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actrt1Q9D9J3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actrt1Q9D9J3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actrt1Q9D9J3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actrt1Q9D9J3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actrt1Q9D9J3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Actrt1Q9D9J3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Actrt1Q9D9J3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Actrt1Q9D9J3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Actrt1Q9D9J3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actrt1Q9D9J3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actrt1Q9D9J3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actrt1Q9D9J3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actrt1Q9D9J3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actrt1Q9D9J3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actrt1Q9D9J3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actrt1Q9D9J3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actrt1Q9D9J3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Actrt1Q9D9J3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actrt1Q9D9J3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actrt1Q9D9J3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Actrt1Q9D9J3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actrt1Q9D9J3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actrt1Q9D9J3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Actrt1Q9D9J3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actrt1Q9D9J3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actrt1Q9D9J3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actrt1Q9D9J3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actrt1Q9D9J3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actrt1Q9D9J3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actrt1Q9D9J3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actrt1Q9D9J3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actrt1Q9D9J3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actrt1Q9D9J3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actrt1Q9D9J3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actrt1Q9D9J3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actrt1Q9D9J3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actrt1Q9D9J3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actrt1Q9D9J3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actrt1Q9D9J3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actrt1Q9D9J3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actrt1Q9D9J3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actrt1Q9D9J3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actrt1Q9D9J3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actrt1Q9D9J3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actrt1Q9D9J3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actrt1Q9D9J3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actrt1Q9D9J3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actrt1Q9D9J3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actrt1Q9D9J3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Actrt1Q9D9J3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actrt1Q9D9J3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actrt1Q9D9J3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actrt1Q9D9J3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actrt1Q9D9J3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actrt1Q9D9J3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actrt1Q9D9J3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actrt1Q9D9J3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actrt1Q9D9J3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actrt1Q9D9J3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actrt1Q9D9J3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actrt1Q9D9J3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actrt1Q9D9J3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms