Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V6

Syap1, Synapse-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syap1Q9D5V6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syap1Q9D5V6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syap1Q9D5V6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syap1Q9D5V6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Syap1Q9D5V6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Syap1Q9D5V6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syap1Q9D5V6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syap1Q9D5V6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syap1Q9D5V6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syap1Q9D5V6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syap1Q9D5V6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syap1Q9D5V6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syap1Q9D5V6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syap1Q9D5V6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syap1Q9D5V6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syap1Q9D5V6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syap1Q9D5V6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syap1Q9D5V6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syap1Q9D5V6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syap1Q9D5V6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syap1Q9D5V6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syap1Q9D5V6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syap1Q9D5V6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syap1Q9D5V6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syap1Q9D5V6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syap1Q9D5V6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syap1Q9D5V6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syap1Q9D5V6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syap1Q9D5V6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syap1Q9D5V6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syap1Q9D5V6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syap1Q9D5V6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syap1Q9D5V6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syap1Q9D5V6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syap1Q9D5V6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syap1Q9D5V6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syap1Q9D5V6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syap1Q9D5V6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syap1Q9D5V6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syap1Q9D5V6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syap1Q9D5V6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syap1Q9D5V6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syap1Q9D5V6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syap1Q9D5V6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syap1Q9D5V6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syap1Q9D5V6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syap1Q9D5V6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syap1Q9D5V6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syap1Q9D5V6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syap1Q9D5V6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syap1Q9D5V6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Syap1Q9D5V6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Syap1Q9D5V6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syap1Q9D5V6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syap1Q9D5V6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Syap1Q9D5V6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syap1Q9D5V6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syap1Q9D5V6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syap1Q9D5V6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syap1Q9D5V6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syap1Q9D5V6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Syap1Q9D5V6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syap1Q9D5V6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syap1Q9D5V6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syap1Q9D5V6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syap1Q9D5V6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syap1Q9D5V6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syap1Q9D5V6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Syap1Q9D5V6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Syap1Q9D5V6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Syap1Q9D5V6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syap1Q9D5V6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syap1Q9D5V6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syap1Q9D5V6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syap1Q9D5V6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Syap1Q9D5V6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syap1Q9D5V6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syap1Q9D5V6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syap1Q9D5V6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syap1Q9D5V6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syap1Q9D5V6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syap1Q9D5V6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syap1Q9D5V6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syap1Q9D5V6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Syap1Q9D5V6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Syap1Q9D5V6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syap1Q9D5V6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syap1Q9D5V6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syap1Q9D5V6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syap1Q9D5V6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syap1Q9D5V6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syap1Q9D5V6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syap1Q9D5V6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syap1Q9D5V6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syap1Q9D5V6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syap1Q9D5V6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syap1Q9D5V6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Syap1Q9D5V6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syap1Q9D5V6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syap1Q9D5V6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms