Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc105Q9D4K7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc105Q9D4K7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc105Q9D4K7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc105Q9D4K7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc105Q9D4K7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc105Q9D4K7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc105Q9D4K7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc105Q9D4K7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc105Q9D4K7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc105Q9D4K7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc105Q9D4K7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc105Q9D4K7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc105Q9D4K7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc105Q9D4K7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc105Q9D4K7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc105Q9D4K7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc105Q9D4K7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc105Q9D4K7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc105Q9D4K7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc105Q9D4K7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc105Q9D4K7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc105Q9D4K7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc105Q9D4K7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc105Q9D4K7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc105Q9D4K7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc105Q9D4K7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc105Q9D4K7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc105Q9D4K7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc105Q9D4K7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc105Q9D4K7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc105Q9D4K7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc105Q9D4K7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc105Q9D4K7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc105Q9D4K7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc105Q9D4K7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc105Q9D4K7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc105Q9D4K7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc105Q9D4K7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc105Q9D4K7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc105Q9D4K7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc105Q9D4K7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc105Q9D4K7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc105Q9D4K7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc105Q9D4K7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc105Q9D4K7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc105Q9D4K7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc105Q9D4K7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc105Q9D4K7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc105Q9D4K7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc105Q9D4K7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc105Q9D4K7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc105Q9D4K7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc105Q9D4K7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc105Q9D4K7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc105Q9D4K7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc105Q9D4K7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc105Q9D4K7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc105Q9D4K7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc105Q9D4K7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc105Q9D4K7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc105Q9D4K7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc105Q9D4K7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc105Q9D4K7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc105Q9D4K7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc105Q9D4K7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc105Q9D4K7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc105Q9D4K7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc105Q9D4K7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc105Q9D4K7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc105Q9D4K7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc105Q9D4K7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc105Q9D4K7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc105Q9D4K7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms