Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clvs1Q9D4C9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clvs1Q9D4C9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clvs1Q9D4C9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clvs1Q9D4C9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clvs1Q9D4C9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clvs1Q9D4C9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clvs1Q9D4C9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clvs1Q9D4C9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clvs1Q9D4C9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Clvs1Q9D4C9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clvs1Q9D4C9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Clvs1Q9D4C9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clvs1Q9D4C9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clvs1Q9D4C9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clvs1Q9D4C9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clvs1Q9D4C9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clvs1Q9D4C9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clvs1Q9D4C9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clvs1Q9D4C9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clvs1Q9D4C9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clvs1Q9D4C9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clvs1Q9D4C9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clvs1Q9D4C9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clvs1Q9D4C9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clvs1Q9D4C9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clvs1Q9D4C9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clvs1Q9D4C9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clvs1Q9D4C9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clvs1Q9D4C9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clvs1Q9D4C9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clvs1Q9D4C9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clvs1Q9D4C9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clvs1Q9D4C9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clvs1Q9D4C9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clvs1Q9D4C9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clvs1Q9D4C9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clvs1Q9D4C9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clvs1Q9D4C9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clvs1Q9D4C9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clvs1Q9D4C9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clvs1Q9D4C9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clvs1Q9D4C9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clvs1Q9D4C9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Clvs1Q9D4C9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clvs1Q9D4C9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clvs1Q9D4C9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clvs1Q9D4C9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clvs1Q9D4C9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clvs1Q9D4C9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clvs1Q9D4C9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clvs1Q9D4C9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clvs1Q9D4C9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clvs1Q9D4C9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clvs1Q9D4C9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clvs1Q9D4C9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clvs1Q9D4C9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clvs1Q9D4C9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clvs1Q9D4C9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clvs1Q9D4C9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clvs1Q9D4C9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clvs1Q9D4C9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clvs1Q9D4C9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clvs1Q9D4C9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clvs1Q9D4C9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clvs1Q9D4C9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clvs1Q9D4C9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clvs1Q9D4C9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clvs1Q9D4C9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clvs1Q9D4C9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clvs1Q9D4C9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clvs1Q9D4C9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clvs1Q9D4C9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clvs1Q9D4C9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clvs1Q9D4C9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clvs1Q9D4C9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clvs1Q9D4C9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clvs1Q9D4C9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clvs1Q9D4C9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clvs1Q9D4C9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clvs1Q9D4C9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clvs1Q9D4C9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clvs1Q9D4C9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clvs1Q9D4C9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clvs1Q9D4C9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clvs1Q9D4C9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clvs1Q9D4C9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clvs1Q9D4C9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clvs1Q9D4C9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clvs1Q9D4C9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clvs1Q9D4C9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clvs1Q9D4C9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clvs1Q9D4C9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clvs1Q9D4C9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clvs1Q9D4C9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clvs1Q9D4C9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clvs1Q9D4C9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clvs1Q9D4C9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clvs1Q9D4C9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clvs1Q9D4C9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms