Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc47Q9D024 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc47Q9D024 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc47Q9D024 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc47Q9D024 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc47Q9D024 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc47Q9D024 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc47Q9D024 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc47Q9D024 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc47Q9D024 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc47Q9D024 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc47Q9D024 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc47Q9D024 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc47Q9D024 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc47Q9D024 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc47Q9D024 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc47Q9D024 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc47Q9D024 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc47Q9D024 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc47Q9D024 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc47Q9D024 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc47Q9D024 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc47Q9D024 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc47Q9D024 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc47Q9D024 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc47Q9D024 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc47Q9D024 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc47Q9D024 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc47Q9D024 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc47Q9D024 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc47Q9D024 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc47Q9D024 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc47Q9D024 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc47Q9D024 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc47Q9D024 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc47Q9D024 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc47Q9D024 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc47Q9D024 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc47Q9D024 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc47Q9D024 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc47Q9D024 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc47Q9D024 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc47Q9D024 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc47Q9D024 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc47Q9D024 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc47Q9D024 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc47Q9D024 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc47Q9D024 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc47Q9D024 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc47Q9D024 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc47Q9D024 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc47Q9D024 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc47Q9D024 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc47Q9D024 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc47Q9D024 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc47Q9D024 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc47Q9D024 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc47Q9D024 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc47Q9D024 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc47Q9D024 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc47Q9D024 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc47Q9D024 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc47Q9D024 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc47Q9D024 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc47Q9D024 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc47Q9D024 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccdc47Q9D024 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc47Q9D024 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc47Q9D024 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc47Q9D024 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc47Q9D024 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc47Q9D024 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc47Q9D024 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc47Q9D024 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc47Q9D024 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc47Q9D024 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc47Q9D024 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc47Q9D024 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc47Q9D024 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc47Q9D024 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc47Q9D024 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc47Q9D024 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc47Q9D024 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc47Q9D024 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc47Q9D024 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc47Q9D024 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc47Q9D024 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc47Q9D024 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc47Q9D024 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc47Q9D024 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc47Q9D024 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc47Q9D024 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc47Q9D024 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc47Q9D024 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc47Q9D024 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc47Q9D024 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc47Q9D024 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc47Q9D024 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc47Q9D024 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc47Q9D024 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms