Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Q9CYI0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Q9CYI0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q9CYI0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Q9CYI0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Q9CYI0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Q9CYI0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Q9CYI0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q9CYI0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Q9CYI0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q9CYI0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q9CYI0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q9CYI0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q9CYI0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q9CYI0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q9CYI0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q9CYI0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q9CYI0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q9CYI0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q9CYI0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q9CYI0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q9CYI0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q9CYI0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q9CYI0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q9CYI0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q9CYI0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q9CYI0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q9CYI0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q9CYI0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q9CYI0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q9CYI0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q9CYI0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q9CYI0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q9CYI0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Q9CYI0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Q9CYI0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q9CYI0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Q9CYI0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Q9CYI0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Q9CYI0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Q9CYI0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q9CYI0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q9CYI0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q9CYI0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q9CYI0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q9CYI0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q9CYI0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q9CYI0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Q9CYI0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q9CYI0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q9CYI0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q9CYI0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q9CYI0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q9CYI0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q9CYI0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9CYI0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9CYI0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9CYI0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q9CYI0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q9CYI0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q9CYI0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q9CYI0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q9CYI0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Q9CYI0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q9CYI0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q9CYI0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q9CYI0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9CYI0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9CYI0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q9CYI0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q9CYI0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q9CYI0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q9CYI0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q9CYI0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q9CYI0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q9CYI0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q9CYI0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Q9CYI0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q9CYI0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q9CYI0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Q9CYI0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q9CYI0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q9CYI0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q9CYI0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Q9CYI0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q9CYI0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q9CYI0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q9CYI0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q9CYI0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q9CYI0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q9CYI0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q9CYI0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Q9CYI0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Q9CYI0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Q9CYI0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Q9CYI0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q9CYI0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q9CYI0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q9CYI0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q9CYI0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms