Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX86

Hnrnpa0, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnrnpa0Q9CX86 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hnrnpa0Q9CX86 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hnrnpa0Q9CX86 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hnrnpa0Q9CX86 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hnrnpa0Q9CX86 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hnrnpa0Q9CX86 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hnrnpa0Q9CX86 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hnrnpa0Q9CX86 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hnrnpa0Q9CX86 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hnrnpa0Q9CX86 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hnrnpa0Q9CX86 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hnrnpa0Q9CX86 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hnrnpa0Q9CX86 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hnrnpa0Q9CX86 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hnrnpa0Q9CX86 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hnrnpa0Q9CX86 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hnrnpa0Q9CX86 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hnrnpa0Q9CX86 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hnrnpa0Q9CX86 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hnrnpa0Q9CX86 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hnrnpa0Q9CX86 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hnrnpa0Q9CX86 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hnrnpa0Q9CX86 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hnrnpa0Q9CX86 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hnrnpa0Q9CX86 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hnrnpa0Q9CX86 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hnrnpa0Q9CX86 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hnrnpa0Q9CX86 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hnrnpa0Q9CX86 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hnrnpa0Q9CX86 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hnrnpa0Q9CX86 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hnrnpa0Q9CX86 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hnrnpa0Q9CX86 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hnrnpa0Q9CX86 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hnrnpa0Q9CX86 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hnrnpa0Q9CX86 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hnrnpa0Q9CX86 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hnrnpa0Q9CX86 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hnrnpa0Q9CX86 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hnrnpa0Q9CX86 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hnrnpa0Q9CX86 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hnrnpa0Q9CX86 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hnrnpa0Q9CX86 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hnrnpa0Q9CX86 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hnrnpa0Q9CX86 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hnrnpa0Q9CX86 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hnrnpa0Q9CX86 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hnrnpa0Q9CX86 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hnrnpa0Q9CX86 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hnrnpa0Q9CX86 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hnrnpa0Q9CX86 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hnrnpa0Q9CX86 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hnrnpa0Q9CX86 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hnrnpa0Q9CX86 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hnrnpa0Q9CX86 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hnrnpa0Q9CX86 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hnrnpa0Q9CX86 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hnrnpa0Q9CX86 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hnrnpa0Q9CX86 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hnrnpa0Q9CX86 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hnrnpa0Q9CX86 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hnrnpa0Q9CX86 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hnrnpa0Q9CX86 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hnrnpa0Q9CX86 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hnrnpa0Q9CX86 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms