Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NmbQ9CR53 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NmbQ9CR53 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NmbQ9CR53 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NmbQ9CR53 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NmbQ9CR53 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NmbQ9CR53 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NmbQ9CR53 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NmbQ9CR53 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NmbQ9CR53 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NmbQ9CR53 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NmbQ9CR53 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NmbQ9CR53 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NmbQ9CR53 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NmbQ9CR53 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NmbQ9CR53 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NmbQ9CR53 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NmbQ9CR53 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NmbQ9CR53 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NmbQ9CR53 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NmbQ9CR53 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NmbQ9CR53 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NmbQ9CR53 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NmbQ9CR53 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NmbQ9CR53 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NmbQ9CR53 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NmbQ9CR53 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NmbQ9CR53 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NmbQ9CR53 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NmbQ9CR53 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NmbQ9CR53 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NmbQ9CR53 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NmbQ9CR53 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NmbQ9CR53 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NmbQ9CR53 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NmbQ9CR53 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NmbQ9CR53 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NmbQ9CR53 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NmbQ9CR53 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NmbQ9CR53 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NmbQ9CR53 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NmbQ9CR53 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NmbQ9CR53 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NmbQ9CR53 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NmbQ9CR53 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NmbQ9CR53 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NmbQ9CR53 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NmbQ9CR53 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NmbQ9CR53 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NmbQ9CR53 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NmbQ9CR53 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NmbQ9CR53 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NmbQ9CR53 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NmbQ9CR53 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NmbQ9CR53 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NmbQ9CR53 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NmbQ9CR53 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NmbQ9CR53 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NmbQ9CR53 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NmbQ9CR53 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NmbQ9CR53 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NmbQ9CR53 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NmbQ9CR53 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NmbQ9CR53 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NmbQ9CR53 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NmbQ9CR53 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NmbQ9CR53 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NmbQ9CR53 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NmbQ9CR53 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NmbQ9CR53 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NmbQ9CR53 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NmbQ9CR53 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NmbQ9CR53 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NmbQ9CR53 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NmbQ9CR53 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms