Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR16

Ppid, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpidQ9CR16 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PpidQ9CR16 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PpidQ9CR16 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PpidQ9CR16 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PpidQ9CR16 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PpidQ9CR16 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PpidQ9CR16 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PpidQ9CR16 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PpidQ9CR16 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PpidQ9CR16 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PpidQ9CR16 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PpidQ9CR16 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PpidQ9CR16 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PpidQ9CR16 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PpidQ9CR16 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PpidQ9CR16 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PpidQ9CR16 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PpidQ9CR16 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PpidQ9CR16 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PpidQ9CR16 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PpidQ9CR16 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PpidQ9CR16 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PpidQ9CR16 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PpidQ9CR16 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PpidQ9CR16 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PpidQ9CR16 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PpidQ9CR16 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PpidQ9CR16 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PpidQ9CR16 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PpidQ9CR16 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PpidQ9CR16 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PpidQ9CR16 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PpidQ9CR16 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PpidQ9CR16 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PpidQ9CR16 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PpidQ9CR16 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PpidQ9CR16 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PpidQ9CR16 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PpidQ9CR16 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PpidQ9CR16 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PpidQ9CR16 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PpidQ9CR16 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PpidQ9CR16 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PpidQ9CR16 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PpidQ9CR16 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PpidQ9CR16 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PpidQ9CR16 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PpidQ9CR16 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PpidQ9CR16 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PpidQ9CR16 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PpidQ9CR16 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PpidQ9CR16 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PpidQ9CR16 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PpidQ9CR16 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PpidQ9CR16 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PpidQ9CR16 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PpidQ9CR16 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PpidQ9CR16 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PpidQ9CR16 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PpidQ9CR16 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PpidQ9CR16 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PpidQ9CR16 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PpidQ9CR16 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PpidQ9CR16 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PpidQ9CR16 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PpidQ9CR16 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PpidQ9CR16 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PpidQ9CR16 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PpidQ9CR16 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PpidQ9CR16 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PpidQ9CR16 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PpidQ9CR16 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PpidQ9CR16 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PpidQ9CR16 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PpidQ9CR16 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PpidQ9CR16 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PpidQ9CR16 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PpidQ9CR16 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PpidQ9CR16 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PpidQ9CR16 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PpidQ9CR16 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PpidQ9CR16 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PpidQ9CR16 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PpidQ9CR16 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PpidQ9CR16 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PpidQ9CR16 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PpidQ9CR16 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PpidQ9CR16 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PpidQ9CR16 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PpidQ9CR16 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PpidQ9CR16 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PpidQ9CR16 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PpidQ9CR16 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PpidQ9CR16 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PpidQ9CR16 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PpidQ9CR16 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PpidQ9CR16 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PpidQ9CR16 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PpidQ9CR16 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PpidQ9CR16 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms