Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RTRAFQ9CQE8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RTRAFQ9CQE8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RTRAFQ9CQE8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RTRAFQ9CQE8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTRAFQ9CQE8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTRAFQ9CQE8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTRAFQ9CQE8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTRAFQ9CQE8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTRAFQ9CQE8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTRAFQ9CQE8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTRAFQ9CQE8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTRAFQ9CQE8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTRAFQ9CQE8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTRAFQ9CQE8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTRAFQ9CQE8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTRAFQ9CQE8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTRAFQ9CQE8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTRAFQ9CQE8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTRAFQ9CQE8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTRAFQ9CQE8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTRAFQ9CQE8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTRAFQ9CQE8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTRAFQ9CQE8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTRAFQ9CQE8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTRAFQ9CQE8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTRAFQ9CQE8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RTRAFQ9CQE8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RTRAFQ9CQE8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RTRAFQ9CQE8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTRAFQ9CQE8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTRAFQ9CQE8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTRAFQ9CQE8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTRAFQ9CQE8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTRAFQ9CQE8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTRAFQ9CQE8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTRAFQ9CQE8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTRAFQ9CQE8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTRAFQ9CQE8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTRAFQ9CQE8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTRAFQ9CQE8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTRAFQ9CQE8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTRAFQ9CQE8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTRAFQ9CQE8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTRAFQ9CQE8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RTRAFQ9CQE8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTRAFQ9CQE8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RTRAFQ9CQE8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTRAFQ9CQE8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTRAFQ9CQE8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTRAFQ9CQE8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTRAFQ9CQE8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTRAFQ9CQE8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTRAFQ9CQE8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTRAFQ9CQE8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTRAFQ9CQE8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RTRAFQ9CQE8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTRAFQ9CQE8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTRAFQ9CQE8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTRAFQ9CQE8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTRAFQ9CQE8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTRAFQ9CQE8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTRAFQ9CQE8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTRAFQ9CQE8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTRAFQ9CQE8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RTRAFQ9CQE8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTRAFQ9CQE8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTRAFQ9CQE8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTRAFQ9CQE8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RTRAFQ9CQE8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTRAFQ9CQE8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTRAFQ9CQE8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms