Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR1

Rwdd4, RWD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd4Q9CPR1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rwdd4Q9CPR1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rwdd4Q9CPR1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rwdd4Q9CPR1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rwdd4Q9CPR1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rwdd4Q9CPR1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rwdd4Q9CPR1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rwdd4Q9CPR1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rwdd4Q9CPR1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rwdd4Q9CPR1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rwdd4Q9CPR1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rwdd4Q9CPR1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rwdd4Q9CPR1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rwdd4Q9CPR1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rwdd4Q9CPR1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rwdd4Q9CPR1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rwdd4Q9CPR1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rwdd4Q9CPR1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rwdd4Q9CPR1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rwdd4Q9CPR1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rwdd4Q9CPR1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rwdd4Q9CPR1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rwdd4Q9CPR1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rwdd4Q9CPR1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rwdd4Q9CPR1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rwdd4Q9CPR1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rwdd4Q9CPR1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rwdd4Q9CPR1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rwdd4Q9CPR1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rwdd4Q9CPR1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rwdd4Q9CPR1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rwdd4Q9CPR1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rwdd4Q9CPR1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rwdd4Q9CPR1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rwdd4Q9CPR1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rwdd4Q9CPR1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rwdd4Q9CPR1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rwdd4Q9CPR1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rwdd4Q9CPR1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rwdd4Q9CPR1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rwdd4Q9CPR1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rwdd4Q9CPR1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rwdd4Q9CPR1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rwdd4Q9CPR1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rwdd4Q9CPR1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rwdd4Q9CPR1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rwdd4Q9CPR1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rwdd4Q9CPR1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rwdd4Q9CPR1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rwdd4Q9CPR1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rwdd4Q9CPR1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rwdd4Q9CPR1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rwdd4Q9CPR1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rwdd4Q9CPR1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rwdd4Q9CPR1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rwdd4Q9CPR1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rwdd4Q9CPR1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rwdd4Q9CPR1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rwdd4Q9CPR1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rwdd4Q9CPR1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rwdd4Q9CPR1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rwdd4Q9CPR1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rwdd4Q9CPR1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rwdd4Q9CPR1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rwdd4Q9CPR1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rwdd4Q9CPR1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rwdd4Q9CPR1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rwdd4Q9CPR1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rwdd4Q9CPR1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rwdd4Q9CPR1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rwdd4Q9CPR1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rwdd4Q9CPR1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rwdd4Q9CPR1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rwdd4Q9CPR1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rwdd4Q9CPR1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rwdd4Q9CPR1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rwdd4Q9CPR1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rwdd4Q9CPR1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rwdd4Q9CPR1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rwdd4Q9CPR1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rwdd4Q9CPR1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rwdd4Q9CPR1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rwdd4Q9CPR1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rwdd4Q9CPR1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rwdd4Q9CPR1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rwdd4Q9CPR1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rwdd4Q9CPR1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rwdd4Q9CPR1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rwdd4Q9CPR1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rwdd4Q9CPR1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rwdd4Q9CPR1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rwdd4Q9CPR1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rwdd4Q9CPR1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rwdd4Q9CPR1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rwdd4Q9CPR1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rwdd4Q9CPR1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rwdd4Q9CPR1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rwdd4Q9CPR1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rwdd4Q9CPR1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rwdd4Q9CPR1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms