Protein–RNA interactions for Protein: Q99M51

Nck1, Cytoplasmic protein NCK1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck1Q99M51 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nck1Q99M51 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nck1Q99M51 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nck1Q99M51 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nck1Q99M51 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nck1Q99M51 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nck1Q99M51 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nck1Q99M51 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nck1Q99M51 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nck1Q99M51 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nck1Q99M51 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nck1Q99M51 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nck1Q99M51 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nck1Q99M51 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nck1Q99M51 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nck1Q99M51 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nck1Q99M51 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nck1Q99M51 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nck1Q99M51 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nck1Q99M51 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nck1Q99M51 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nck1Q99M51 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nck1Q99M51 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nck1Q99M51 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nck1Q99M51 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nck1Q99M51 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nck1Q99M51 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nck1Q99M51 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nck1Q99M51 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nck1Q99M51 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nck1Q99M51 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nck1Q99M51 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nck1Q99M51 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nck1Q99M51 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nck1Q99M51 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nck1Q99M51 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nck1Q99M51 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nck1Q99M51 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nck1Q99M51 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nck1Q99M51 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nck1Q99M51 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nck1Q99M51 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nck1Q99M51 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nck1Q99M51 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nck1Q99M51 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nck1Q99M51 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nck1Q99M51 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nck1Q99M51 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nck1Q99M51 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nck1Q99M51 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nck1Q99M51 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nck1Q99M51 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nck1Q99M51 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nck1Q99M51 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nck1Q99M51 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nck1Q99M51 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nck1Q99M51 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nck1Q99M51 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nck1Q99M51 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nck1Q99M51 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nck1Q99M51 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nck1Q99M51 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nck1Q99M51 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nck1Q99M51 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nck1Q99M51 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nck1Q99M51 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nck1Q99M51 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nck1Q99M51 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nck1Q99M51 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nck1Q99M51 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nck1Q99M51 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nck1Q99M51 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nck1Q99M51 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nck1Q99M51 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nck1Q99M51 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nck1Q99M51 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nck1Q99M51 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nck1Q99M51 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nck1Q99M51 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nck1Q99M51 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nck1Q99M51 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nck1Q99M51 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nck1Q99M51 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nck1Q99M51 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nck1Q99M51 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nck1Q99M51 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nck1Q99M51 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nck1Q99M51 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nck1Q99M51 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nck1Q99M51 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nck1Q99M51 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nck1Q99M51 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nck1Q99M51 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nck1Q99M51 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nck1Q99M51 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms