Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pls3Q99K51 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pls3Q99K51 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pls3Q99K51 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pls3Q99K51 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pls3Q99K51 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pls3Q99K51 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Pls3Q99K51 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Pls3Q99K51 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pls3Q99K51 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pls3Q99K51 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pls3Q99K51 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pls3Q99K51 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pls3Q99K51 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pls3Q99K51 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pls3Q99K51 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pls3Q99K51 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pls3Q99K51 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pls3Q99K51 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pls3Q99K51 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pls3Q99K51 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pls3Q99K51 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pls3Q99K51 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Pls3Q99K51 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pls3Q99K51 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pls3Q99K51 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pls3Q99K51 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pls3Q99K51 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pls3Q99K51 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pls3Q99K51 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pls3Q99K51 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pls3Q99K51 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pls3Q99K51 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pls3Q99K51 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pls3Q99K51 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pls3Q99K51 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pls3Q99K51 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pls3Q99K51 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pls3Q99K51 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pls3Q99K51 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pls3Q99K51 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pls3Q99K51 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pls3Q99K51 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pls3Q99K51 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Pls3Q99K51 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pls3Q99K51 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pls3Q99K51 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pls3Q99K51 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pls3Q99K51 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pls3Q99K51 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pls3Q99K51 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pls3Q99K51 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pls3Q99K51 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pls3Q99K51 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pls3Q99K51 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pls3Q99K51 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pls3Q99K51 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pls3Q99K51 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pls3Q99K51 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pls3Q99K51 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pls3Q99K51 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pls3Q99K51 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pls3Q99K51 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pls3Q99K51 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pls3Q99K51 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pls3Q99K51 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pls3Q99K51 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pls3Q99K51 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pls3Q99K51 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pls3Q99K51 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pls3Q99K51 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pls3Q99K51 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pls3Q99K51 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pls3Q99K51 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pls3Q99K51 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pls3Q99K51 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pls3Q99K51 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pls3Q99K51 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pls3Q99K51 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pls3Q99K51 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pls3Q99K51 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pls3Q99K51 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pls3Q99K51 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pls3Q99K51 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pls3Q99K51 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pls3Q99K51 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pls3Q99K51 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pls3Q99K51 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Pls3Q99K51 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pls3Q99K51 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Pls3Q99K51 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pls3Q99K51 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pls3Q99K51 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pls3Q99K51 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pls3Q99K51 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pls3Q99K51 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pls3Q99K51 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pls3Q99K51 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pls3Q99K51 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pls3Q99K51 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms