Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Psmd6Q99JI4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psmd6Q99JI4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psmd6Q99JI4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psmd6Q99JI4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psmd6Q99JI4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psmd6Q99JI4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psmd6Q99JI4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psmd6Q99JI4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Psmd6Q99JI4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psmd6Q99JI4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psmd6Q99JI4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psmd6Q99JI4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psmd6Q99JI4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psmd6Q99JI4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psmd6Q99JI4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Psmd6Q99JI4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Psmd6Q99JI4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Psmd6Q99JI4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Psmd6Q99JI4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Psmd6Q99JI4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Psmd6Q99JI4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Psmd6Q99JI4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psmd6Q99JI4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Psmd6Q99JI4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Psmd6Q99JI4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Psmd6Q99JI4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Psmd6Q99JI4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Psmd6Q99JI4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Psmd6Q99JI4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Psmd6Q99JI4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Psmd6Q99JI4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Psmd6Q99JI4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Psmd6Q99JI4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Psmd6Q99JI4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Psmd6Q99JI4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Psmd6Q99JI4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Psmd6Q99JI4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Psmd6Q99JI4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Psmd6Q99JI4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Psmd6Q99JI4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Psmd6Q99JI4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Psmd6Q99JI4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Psmd6Q99JI4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Psmd6Q99JI4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Psmd6Q99JI4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psmd6Q99JI4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psmd6Q99JI4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psmd6Q99JI4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psmd6Q99JI4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psmd6Q99JI4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Psmd6Q99JI4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Psmd6Q99JI4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Psmd6Q99JI4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psmd6Q99JI4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psmd6Q99JI4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psmd6Q99JI4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psmd6Q99JI4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmd6Q99JI4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmd6Q99JI4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmd6Q99JI4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmd6Q99JI4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmd6Q99JI4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psmd6Q99JI4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psmd6Q99JI4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psmd6Q99JI4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psmd6Q99JI4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psmd6Q99JI4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Psmd6Q99JI4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Psmd6Q99JI4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Psmd6Q99JI4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Psmd6Q99JI4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psmd6Q99JI4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psmd6Q99JI4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psmd6Q99JI4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psmd6Q99JI4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psmd6Q99JI4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psmd6Q99JI4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psmd6Q99JI4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psmd6Q99JI4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psmd6Q99JI4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Psmd6Q99JI4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psmd6Q99JI4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psmd6Q99JI4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psmd6Q99JI4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psmd6Q99JI4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psmd6Q99JI4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psmd6Q99JI4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psmd6Q99JI4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psmd6Q99JI4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psmd6Q99JI4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psmd6Q99JI4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psmd6Q99JI4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmd6Q99JI4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmd6Q99JI4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmd6Q99JI4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmd6Q99JI4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psmd6Q99JI4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psmd6Q99JI4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psmd6Q99JI4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms