Protein–RNA interactions for Protein: Q99J45

Nrbp1, Nuclear receptor-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbp1Q99J45 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nrbp1Q99J45 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nrbp1Q99J45 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nrbp1Q99J45 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nrbp1Q99J45 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nrbp1Q99J45 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Nrbp1Q99J45 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nrbp1Q99J45 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nrbp1Q99J45 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nrbp1Q99J45 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nrbp1Q99J45 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nrbp1Q99J45 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nrbp1Q99J45 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Nrbp1Q99J45 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nrbp1Q99J45 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nrbp1Q99J45 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nrbp1Q99J45 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nrbp1Q99J45 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nrbp1Q99J45 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nrbp1Q99J45 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nrbp1Q99J45 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nrbp1Q99J45 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nrbp1Q99J45 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nrbp1Q99J45 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nrbp1Q99J45 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nrbp1Q99J45 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nrbp1Q99J45 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nrbp1Q99J45 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nrbp1Q99J45 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nrbp1Q99J45 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nrbp1Q99J45 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nrbp1Q99J45 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Nrbp1Q99J45 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nrbp1Q99J45 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Nrbp1Q99J45 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nrbp1Q99J45 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nrbp1Q99J45 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nrbp1Q99J45 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Nrbp1Q99J45 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nrbp1Q99J45 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nrbp1Q99J45 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nrbp1Q99J45 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nrbp1Q99J45 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nrbp1Q99J45 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Nrbp1Q99J45 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nrbp1Q99J45 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nrbp1Q99J45 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nrbp1Q99J45 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nrbp1Q99J45 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nrbp1Q99J45 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nrbp1Q99J45 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nrbp1Q99J45 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nrbp1Q99J45 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nrbp1Q99J45 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nrbp1Q99J45 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nrbp1Q99J45 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nrbp1Q99J45 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nrbp1Q99J45 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nrbp1Q99J45 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nrbp1Q99J45 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nrbp1Q99J45 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nrbp1Q99J45 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nrbp1Q99J45 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nrbp1Q99J45 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nrbp1Q99J45 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nrbp1Q99J45 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nrbp1Q99J45 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nrbp1Q99J45 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nrbp1Q99J45 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nrbp1Q99J45 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nrbp1Q99J45 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nrbp1Q99J45 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nrbp1Q99J45 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nrbp1Q99J45 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nrbp1Q99J45 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nrbp1Q99J45 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nrbp1Q99J45 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nrbp1Q99J45 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nrbp1Q99J45 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Nrbp1Q99J45 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nrbp1Q99J45 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nrbp1Q99J45 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nrbp1Q99J45 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nrbp1Q99J45 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nrbp1Q99J45 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nrbp1Q99J45 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nrbp1Q99J45 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nrbp1Q99J45 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nrbp1Q99J45 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nrbp1Q99J45 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Nrbp1Q99J45 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nrbp1Q99J45 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nrbp1Q99J45 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nrbp1Q99J45 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nrbp1Q99J45 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nrbp1Q99J45 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nrbp1Q99J45 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nrbp1Q99J45 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nrbp1Q99J45 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nrbp1Q99J45 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms