Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp4Q921I6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp4Q921I6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp4Q921I6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bp4Q921I6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bp4Q921I6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bp4Q921I6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp4Q921I6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp4Q921I6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp4Q921I6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp4Q921I6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp4Q921I6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp4Q921I6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bp4Q921I6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bp4Q921I6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bp4Q921I6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp4Q921I6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp4Q921I6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp4Q921I6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp4Q921I6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp4Q921I6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp4Q921I6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3bp4Q921I6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3bp4Q921I6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3bp4Q921I6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3bp4Q921I6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3bp4Q921I6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3bp4Q921I6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3bp4Q921I6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3bp4Q921I6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3bp4Q921I6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3bp4Q921I6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3bp4Q921I6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3bp4Q921I6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3bp4Q921I6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3bp4Q921I6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3bp4Q921I6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3bp4Q921I6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3bp4Q921I6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3bp4Q921I6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3bp4Q921I6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sh3bp4Q921I6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3bp4Q921I6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3bp4Q921I6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3bp4Q921I6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3bp4Q921I6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3bp4Q921I6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3bp4Q921I6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp4Q921I6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp4Q921I6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp4Q921I6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp4Q921I6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bp4Q921I6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bp4Q921I6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bp4Q921I6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp4Q921I6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp4Q921I6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp4Q921I6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp4Q921I6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp4Q921I6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp4Q921I6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp4Q921I6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bp4Q921I6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp4Q921I6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp4Q921I6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bp4Q921I6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp4Q921I6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp4Q921I6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp4Q921I6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp4Q921I6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bp4Q921I6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp4Q921I6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp4Q921I6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp4Q921I6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp4Q921I6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp4Q921I6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp4Q921I6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp4Q921I6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp4Q921I6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp4Q921I6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp4Q921I6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp4Q921I6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp4Q921I6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp4Q921I6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp4Q921I6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp4Q921I6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp4Q921I6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp4Q921I6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp4Q921I6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp4Q921I6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sh3bp4Q921I6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sh3bp4Q921I6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp4Q921I6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp4Q921I6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp4Q921I6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp4Q921I6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp4Q921I6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp4Q921I6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp4Q921I6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp4Q921I6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms