Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atl3Q91YH5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atl3Q91YH5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Atl3Q91YH5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Atl3Q91YH5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Atl3Q91YH5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Atl3Q91YH5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atl3Q91YH5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atl3Q91YH5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atl3Q91YH5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Atl3Q91YH5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atl3Q91YH5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Atl3Q91YH5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atl3Q91YH5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atl3Q91YH5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atl3Q91YH5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atl3Q91YH5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Atl3Q91YH5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atl3Q91YH5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atl3Q91YH5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Atl3Q91YH5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Atl3Q91YH5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atl3Q91YH5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atl3Q91YH5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atl3Q91YH5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atl3Q91YH5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atl3Q91YH5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atl3Q91YH5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Atl3Q91YH5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Atl3Q91YH5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Atl3Q91YH5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atl3Q91YH5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Atl3Q91YH5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atl3Q91YH5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atl3Q91YH5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atl3Q91YH5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atl3Q91YH5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Atl3Q91YH5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Atl3Q91YH5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Atl3Q91YH5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Atl3Q91YH5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Atl3Q91YH5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Atl3Q91YH5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atl3Q91YH5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atl3Q91YH5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atl3Q91YH5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Atl3Q91YH5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atl3Q91YH5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atl3Q91YH5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atl3Q91YH5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atl3Q91YH5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atl3Q91YH5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atl3Q91YH5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Atl3Q91YH5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atl3Q91YH5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atl3Q91YH5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atl3Q91YH5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atl3Q91YH5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Atl3Q91YH5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atl3Q91YH5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Atl3Q91YH5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atl3Q91YH5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atl3Q91YH5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atl3Q91YH5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atl3Q91YH5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atl3Q91YH5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atl3Q91YH5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atl3Q91YH5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atl3Q91YH5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atl3Q91YH5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atl3Q91YH5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Atl3Q91YH5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atl3Q91YH5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atl3Q91YH5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atl3Q91YH5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atl3Q91YH5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atl3Q91YH5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atl3Q91YH5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atl3Q91YH5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atl3Q91YH5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atl3Q91YH5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atl3Q91YH5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atl3Q91YH5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atl3Q91YH5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atl3Q91YH5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atl3Q91YH5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atl3Q91YH5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atl3Q91YH5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atl3Q91YH5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atl3Q91YH5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atl3Q91YH5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atl3Q91YH5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atl3Q91YH5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atl3Q91YH5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atl3Q91YH5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atl3Q91YH5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atl3Q91YH5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atl3Q91YH5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atl3Q91YH5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atl3Q91YH5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms