Protein–RNA interactions for Protein: Q91XZ7

Pcdhb3, Protocadherin beta 3, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb3Q91XZ7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdhb3Q91XZ7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdhb3Q91XZ7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdhb3Q91XZ7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdhb3Q91XZ7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdhb3Q91XZ7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdhb3Q91XZ7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdhb3Q91XZ7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdhb3Q91XZ7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdhb3Q91XZ7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdhb3Q91XZ7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdhb3Q91XZ7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdhb3Q91XZ7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdhb3Q91XZ7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdhb3Q91XZ7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdhb3Q91XZ7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdhb3Q91XZ7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdhb3Q91XZ7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdhb3Q91XZ7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcdhb3Q91XZ7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhb3Q91XZ7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhb3Q91XZ7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhb3Q91XZ7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdhb3Q91XZ7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdhb3Q91XZ7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdhb3Q91XZ7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdhb3Q91XZ7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdhb3Q91XZ7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdhb3Q91XZ7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdhb3Q91XZ7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdhb3Q91XZ7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhb3Q91XZ7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhb3Q91XZ7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhb3Q91XZ7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhb3Q91XZ7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhb3Q91XZ7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhb3Q91XZ7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhb3Q91XZ7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhb3Q91XZ7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdhb3Q91XZ7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdhb3Q91XZ7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdhb3Q91XZ7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdhb3Q91XZ7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdhb3Q91XZ7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdhb3Q91XZ7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdhb3Q91XZ7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhb3Q91XZ7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhb3Q91XZ7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb3Q91XZ7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb3Q91XZ7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb3Q91XZ7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb3Q91XZ7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb3Q91XZ7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb3Q91XZ7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb3Q91XZ7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdhb3Q91XZ7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdhb3Q91XZ7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdhb3Q91XZ7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb3Q91XZ7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb3Q91XZ7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb3Q91XZ7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb3Q91XZ7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhb3Q91XZ7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhb3Q91XZ7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhb3Q91XZ7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhb3Q91XZ7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb3Q91XZ7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb3Q91XZ7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb3Q91XZ7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhb3Q91XZ7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdhb3Q91XZ7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms