Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gga1Q8R0H9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gga1Q8R0H9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gga1Q8R0H9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gga1Q8R0H9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gga1Q8R0H9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gga1Q8R0H9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gga1Q8R0H9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gga1Q8R0H9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gga1Q8R0H9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gga1Q8R0H9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gga1Q8R0H9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gga1Q8R0H9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gga1Q8R0H9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gga1Q8R0H9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gga1Q8R0H9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gga1Q8R0H9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gga1Q8R0H9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gga1Q8R0H9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gga1Q8R0H9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gga1Q8R0H9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gga1Q8R0H9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gga1Q8R0H9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gga1Q8R0H9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gga1Q8R0H9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Gga1Q8R0H9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gga1Q8R0H9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gga1Q8R0H9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gga1Q8R0H9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gga1Q8R0H9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gga1Q8R0H9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gga1Q8R0H9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gga1Q8R0H9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gga1Q8R0H9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gga1Q8R0H9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gga1Q8R0H9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Gga1Q8R0H9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gga1Q8R0H9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gga1Q8R0H9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gga1Q8R0H9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gga1Q8R0H9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gga1Q8R0H9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gga1Q8R0H9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gga1Q8R0H9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gga1Q8R0H9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gga1Q8R0H9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gga1Q8R0H9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gga1Q8R0H9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gga1Q8R0H9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gga1Q8R0H9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gga1Q8R0H9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gga1Q8R0H9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gga1Q8R0H9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gga1Q8R0H9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gga1Q8R0H9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gga1Q8R0H9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gga1Q8R0H9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gga1Q8R0H9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gga1Q8R0H9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gga1Q8R0H9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gga1Q8R0H9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gga1Q8R0H9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gga1Q8R0H9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gga1Q8R0H9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gga1Q8R0H9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gga1Q8R0H9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gga1Q8R0H9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gga1Q8R0H9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gga1Q8R0H9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gga1Q8R0H9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gga1Q8R0H9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gga1Q8R0H9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gga1Q8R0H9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gga1Q8R0H9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gga1Q8R0H9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gga1Q8R0H9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gga1Q8R0H9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gga1Q8R0H9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gga1Q8R0H9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gga1Q8R0H9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gga1Q8R0H9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gga1Q8R0H9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gga1Q8R0H9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gga1Q8R0H9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gga1Q8R0H9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gga1Q8R0H9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gga1Q8R0H9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gga1Q8R0H9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gga1Q8R0H9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gga1Q8R0H9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gga1Q8R0H9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gga1Q8R0H9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gga1Q8R0H9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gga1Q8R0H9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gga1Q8R0H9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gga1Q8R0H9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gga1Q8R0H9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gga1Q8R0H9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gga1Q8R0H9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gga1Q8R0H9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.4 ms