Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casc3Q8K3W3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Casc3Q8K3W3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casc3Q8K3W3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casc3Q8K3W3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casc3Q8K3W3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casc3Q8K3W3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casc3Q8K3W3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casc3Q8K3W3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casc3Q8K3W3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casc3Q8K3W3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casc3Q8K3W3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casc3Q8K3W3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casc3Q8K3W3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc3Q8K3W3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc3Q8K3W3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc3Q8K3W3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc3Q8K3W3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casc3Q8K3W3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casc3Q8K3W3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casc3Q8K3W3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Casc3Q8K3W3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casc3Q8K3W3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casc3Q8K3W3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casc3Q8K3W3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casc3Q8K3W3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Casc3Q8K3W3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casc3Q8K3W3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casc3Q8K3W3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casc3Q8K3W3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casc3Q8K3W3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casc3Q8K3W3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casc3Q8K3W3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casc3Q8K3W3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casc3Q8K3W3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casc3Q8K3W3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casc3Q8K3W3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casc3Q8K3W3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casc3Q8K3W3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casc3Q8K3W3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casc3Q8K3W3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casc3Q8K3W3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casc3Q8K3W3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casc3Q8K3W3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Casc3Q8K3W3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casc3Q8K3W3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casc3Q8K3W3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casc3Q8K3W3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casc3Q8K3W3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casc3Q8K3W3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casc3Q8K3W3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casc3Q8K3W3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casc3Q8K3W3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Casc3Q8K3W3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casc3Q8K3W3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casc3Q8K3W3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casc3Q8K3W3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casc3Q8K3W3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Casc3Q8K3W3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casc3Q8K3W3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casc3Q8K3W3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casc3Q8K3W3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casc3Q8K3W3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casc3Q8K3W3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Casc3Q8K3W3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casc3Q8K3W3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casc3Q8K3W3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casc3Q8K3W3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casc3Q8K3W3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Casc3Q8K3W3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casc3Q8K3W3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casc3Q8K3W3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casc3Q8K3W3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casc3Q8K3W3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms