Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pggt1bQ8BUY9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pggt1bQ8BUY9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pggt1bQ8BUY9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pggt1bQ8BUY9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pggt1bQ8BUY9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pggt1bQ8BUY9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pggt1bQ8BUY9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pggt1bQ8BUY9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pggt1bQ8BUY9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pggt1bQ8BUY9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pggt1bQ8BUY9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pggt1bQ8BUY9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pggt1bQ8BUY9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pggt1bQ8BUY9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pggt1bQ8BUY9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pggt1bQ8BUY9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pggt1bQ8BUY9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pggt1bQ8BUY9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pggt1bQ8BUY9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pggt1bQ8BUY9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pggt1bQ8BUY9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pggt1bQ8BUY9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pggt1bQ8BUY9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pggt1bQ8BUY9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pggt1bQ8BUY9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pggt1bQ8BUY9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pggt1bQ8BUY9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pggt1bQ8BUY9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pggt1bQ8BUY9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pggt1bQ8BUY9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pggt1bQ8BUY9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pggt1bQ8BUY9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pggt1bQ8BUY9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pggt1bQ8BUY9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pggt1bQ8BUY9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pggt1bQ8BUY9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pggt1bQ8BUY9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pggt1bQ8BUY9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pggt1bQ8BUY9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pggt1bQ8BUY9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pggt1bQ8BUY9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pggt1bQ8BUY9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pggt1bQ8BUY9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pggt1bQ8BUY9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pggt1bQ8BUY9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pggt1bQ8BUY9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pggt1bQ8BUY9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pggt1bQ8BUY9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pggt1bQ8BUY9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pggt1bQ8BUY9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pggt1bQ8BUY9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pggt1bQ8BUY9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pggt1bQ8BUY9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pggt1bQ8BUY9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pggt1bQ8BUY9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pggt1bQ8BUY9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pggt1bQ8BUY9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pggt1bQ8BUY9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pggt1bQ8BUY9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pggt1bQ8BUY9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pggt1bQ8BUY9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pggt1bQ8BUY9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pggt1bQ8BUY9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pggt1bQ8BUY9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pggt1bQ8BUY9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pggt1bQ8BUY9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pggt1bQ8BUY9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pggt1bQ8BUY9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pggt1bQ8BUY9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pggt1bQ8BUY9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pggt1bQ8BUY9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pggt1bQ8BUY9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pggt1bQ8BUY9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pggt1bQ8BUY9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pggt1bQ8BUY9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pggt1bQ8BUY9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pggt1bQ8BUY9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pggt1bQ8BUY9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pggt1bQ8BUY9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pggt1bQ8BUY9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pggt1bQ8BUY9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pggt1bQ8BUY9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pggt1bQ8BUY9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pggt1bQ8BUY9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pggt1bQ8BUY9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pggt1bQ8BUY9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pggt1bQ8BUY9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pggt1bQ8BUY9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pggt1bQ8BUY9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pggt1bQ8BUY9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pggt1bQ8BUY9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pggt1bQ8BUY9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pggt1bQ8BUY9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pggt1bQ8BUY9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms