Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRK8

Prkaa2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa2Q8BRK8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkaa2Q8BRK8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkaa2Q8BRK8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Prkaa2Q8BRK8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkaa2Q8BRK8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkaa2Q8BRK8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkaa2Q8BRK8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prkaa2Q8BRK8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkaa2Q8BRK8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkaa2Q8BRK8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prkaa2Q8BRK8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prkaa2Q8BRK8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkaa2Q8BRK8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkaa2Q8BRK8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkaa2Q8BRK8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkaa2Q8BRK8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkaa2Q8BRK8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkaa2Q8BRK8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkaa2Q8BRK8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkaa2Q8BRK8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkaa2Q8BRK8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkaa2Q8BRK8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkaa2Q8BRK8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkaa2Q8BRK8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkaa2Q8BRK8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkaa2Q8BRK8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkaa2Q8BRK8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkaa2Q8BRK8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkaa2Q8BRK8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkaa2Q8BRK8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkaa2Q8BRK8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkaa2Q8BRK8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkaa2Q8BRK8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkaa2Q8BRK8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkaa2Q8BRK8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkaa2Q8BRK8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkaa2Q8BRK8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkaa2Q8BRK8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkaa2Q8BRK8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkaa2Q8BRK8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkaa2Q8BRK8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkaa2Q8BRK8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkaa2Q8BRK8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkaa2Q8BRK8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkaa2Q8BRK8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prkaa2Q8BRK8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkaa2Q8BRK8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkaa2Q8BRK8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkaa2Q8BRK8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkaa2Q8BRK8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkaa2Q8BRK8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkaa2Q8BRK8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkaa2Q8BRK8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkaa2Q8BRK8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkaa2Q8BRK8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkaa2Q8BRK8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkaa2Q8BRK8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkaa2Q8BRK8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkaa2Q8BRK8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkaa2Q8BRK8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkaa2Q8BRK8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkaa2Q8BRK8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkaa2Q8BRK8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkaa2Q8BRK8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkaa2Q8BRK8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkaa2Q8BRK8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkaa2Q8BRK8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkaa2Q8BRK8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Prkaa2Q8BRK8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkaa2Q8BRK8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkaa2Q8BRK8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkaa2Q8BRK8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkaa2Q8BRK8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkaa2Q8BRK8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkaa2Q8BRK8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkaa2Q8BRK8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkaa2Q8BRK8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkaa2Q8BRK8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkaa2Q8BRK8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkaa2Q8BRK8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkaa2Q8BRK8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkaa2Q8BRK8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkaa2Q8BRK8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkaa2Q8BRK8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkaa2Q8BRK8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkaa2Q8BRK8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkaa2Q8BRK8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkaa2Q8BRK8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkaa2Q8BRK8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkaa2Q8BRK8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkaa2Q8BRK8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkaa2Q8BRK8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkaa2Q8BRK8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkaa2Q8BRK8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkaa2Q8BRK8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkaa2Q8BRK8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkaa2Q8BRK8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkaa2Q8BRK8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkaa2Q8BRK8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkaa2Q8BRK8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms