Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bicd1Q8BR07 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bicd1Q8BR07 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bicd1Q8BR07 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bicd1Q8BR07 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bicd1Q8BR07 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bicd1Q8BR07 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bicd1Q8BR07 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bicd1Q8BR07 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bicd1Q8BR07 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bicd1Q8BR07 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bicd1Q8BR07 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bicd1Q8BR07 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bicd1Q8BR07 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bicd1Q8BR07 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bicd1Q8BR07 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bicd1Q8BR07 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bicd1Q8BR07 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bicd1Q8BR07 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bicd1Q8BR07 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bicd1Q8BR07 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bicd1Q8BR07 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bicd1Q8BR07 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bicd1Q8BR07 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bicd1Q8BR07 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bicd1Q8BR07 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bicd1Q8BR07 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bicd1Q8BR07 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bicd1Q8BR07 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bicd1Q8BR07 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bicd1Q8BR07 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bicd1Q8BR07 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bicd1Q8BR07 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bicd1Q8BR07 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bicd1Q8BR07 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bicd1Q8BR07 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Bicd1Q8BR07 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bicd1Q8BR07 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bicd1Q8BR07 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bicd1Q8BR07 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bicd1Q8BR07 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bicd1Q8BR07 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bicd1Q8BR07 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Bicd1Q8BR07 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bicd1Q8BR07 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bicd1Q8BR07 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bicd1Q8BR07 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bicd1Q8BR07 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bicd1Q8BR07 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bicd1Q8BR07 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Bicd1Q8BR07 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bicd1Q8BR07 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bicd1Q8BR07 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bicd1Q8BR07 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bicd1Q8BR07 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bicd1Q8BR07 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bicd1Q8BR07 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bicd1Q8BR07 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bicd1Q8BR07 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bicd1Q8BR07 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bicd1Q8BR07 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bicd1Q8BR07 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bicd1Q8BR07 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bicd1Q8BR07 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bicd1Q8BR07 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bicd1Q8BR07 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bicd1Q8BR07 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bicd1Q8BR07 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bicd1Q8BR07 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bicd1Q8BR07 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bicd1Q8BR07 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bicd1Q8BR07 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bicd1Q8BR07 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bicd1Q8BR07 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bicd1Q8BR07 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bicd1Q8BR07 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bicd1Q8BR07 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bicd1Q8BR07 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bicd1Q8BR07 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bicd1Q8BR07 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bicd1Q8BR07 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bicd1Q8BR07 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bicd1Q8BR07 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bicd1Q8BR07 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bicd1Q8BR07 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bicd1Q8BR07 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bicd1Q8BR07 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bicd1Q8BR07 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bicd1Q8BR07 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bicd1Q8BR07 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bicd1Q8BR07 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bicd1Q8BR07 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bicd1Q8BR07 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bicd1Q8BR07 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bicd1Q8BR07 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bicd1Q8BR07 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bicd1Q8BR07 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bicd1Q8BR07 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bicd1Q8BR07 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bicd1Q8BR07 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms