Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rufy1Q8BIJ7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rufy1Q8BIJ7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rufy1Q8BIJ7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rufy1Q8BIJ7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rufy1Q8BIJ7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rufy1Q8BIJ7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rufy1Q8BIJ7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rufy1Q8BIJ7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rufy1Q8BIJ7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rufy1Q8BIJ7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rufy1Q8BIJ7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rufy1Q8BIJ7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rufy1Q8BIJ7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rufy1Q8BIJ7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rufy1Q8BIJ7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rufy1Q8BIJ7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rufy1Q8BIJ7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rufy1Q8BIJ7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rufy1Q8BIJ7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rufy1Q8BIJ7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rufy1Q8BIJ7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rufy1Q8BIJ7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rufy1Q8BIJ7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rufy1Q8BIJ7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rufy1Q8BIJ7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rufy1Q8BIJ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rufy1Q8BIJ7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy1Q8BIJ7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy1Q8BIJ7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy1Q8BIJ7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rufy1Q8BIJ7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rufy1Q8BIJ7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rufy1Q8BIJ7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rufy1Q8BIJ7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rufy1Q8BIJ7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rufy1Q8BIJ7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rufy1Q8BIJ7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rufy1Q8BIJ7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rufy1Q8BIJ7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rufy1Q8BIJ7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rufy1Q8BIJ7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rufy1Q8BIJ7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rufy1Q8BIJ7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rufy1Q8BIJ7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rufy1Q8BIJ7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rufy1Q8BIJ7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rufy1Q8BIJ7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rufy1Q8BIJ7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rufy1Q8BIJ7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rufy1Q8BIJ7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rufy1Q8BIJ7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rufy1Q8BIJ7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rufy1Q8BIJ7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rufy1Q8BIJ7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rufy1Q8BIJ7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rufy1Q8BIJ7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rufy1Q8BIJ7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rufy1Q8BIJ7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rufy1Q8BIJ7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rufy1Q8BIJ7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rufy1Q8BIJ7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rufy1Q8BIJ7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rufy1Q8BIJ7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rufy1Q8BIJ7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rufy1Q8BIJ7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rufy1Q8BIJ7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rufy1Q8BIJ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rufy1Q8BIJ7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rufy1Q8BIJ7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rufy1Q8BIJ7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rufy1Q8BIJ7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rufy1Q8BIJ7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rufy1Q8BIJ7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rufy1Q8BIJ7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rufy1Q8BIJ7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rufy1Q8BIJ7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rufy1Q8BIJ7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rufy1Q8BIJ7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rufy1Q8BIJ7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rufy1Q8BIJ7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rufy1Q8BIJ7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rufy1Q8BIJ7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rufy1Q8BIJ7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rufy1Q8BIJ7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rufy1Q8BIJ7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rufy1Q8BIJ7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rufy1Q8BIJ7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rufy1Q8BIJ7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rufy1Q8BIJ7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rufy1Q8BIJ7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rufy1Q8BIJ7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rufy1Q8BIJ7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rufy1Q8BIJ7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rufy1Q8BIJ7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rufy1Q8BIJ7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rufy1Q8BIJ7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms