Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gabra5Q8BHJ7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gabra5Q8BHJ7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gabra5Q8BHJ7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gabra5Q8BHJ7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gabra5Q8BHJ7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gabra5Q8BHJ7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gabra5Q8BHJ7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gabra5Q8BHJ7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabra5Q8BHJ7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabra5Q8BHJ7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gabra5Q8BHJ7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gabra5Q8BHJ7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gabra5Q8BHJ7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gabra5Q8BHJ7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gabra5Q8BHJ7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gabra5Q8BHJ7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gabra5Q8BHJ7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gabra5Q8BHJ7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gabra5Q8BHJ7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabra5Q8BHJ7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabra5Q8BHJ7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabra5Q8BHJ7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabra5Q8BHJ7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gabra5Q8BHJ7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gabra5Q8BHJ7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gabra5Q8BHJ7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gabra5Q8BHJ7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gabra5Q8BHJ7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gabra5Q8BHJ7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gabra5Q8BHJ7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gabra5Q8BHJ7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabra5Q8BHJ7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabra5Q8BHJ7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabra5Q8BHJ7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabra5Q8BHJ7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabra5Q8BHJ7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabra5Q8BHJ7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabra5Q8BHJ7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabra5Q8BHJ7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabra5Q8BHJ7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabra5Q8BHJ7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabra5Q8BHJ7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabra5Q8BHJ7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabra5Q8BHJ7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabra5Q8BHJ7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabra5Q8BHJ7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabra5Q8BHJ7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gabra5Q8BHJ7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gabra5Q8BHJ7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gabra5Q8BHJ7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabra5Q8BHJ7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabra5Q8BHJ7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabra5Q8BHJ7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabra5Q8BHJ7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabra5Q8BHJ7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabra5Q8BHJ7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabra5Q8BHJ7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabra5Q8BHJ7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabra5Q8BHJ7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabra5Q8BHJ7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gabra5Q8BHJ7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gabra5Q8BHJ7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gabra5Q8BHJ7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gabra5Q8BHJ7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gabra5Q8BHJ7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gabra5Q8BHJ7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gabra5Q8BHJ7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gabra5Q8BHJ7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabra5Q8BHJ7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabra5Q8BHJ7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabra5Q8BHJ7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gabra5Q8BHJ7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gabra5Q8BHJ7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gabra5Q8BHJ7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gabra5Q8BHJ7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabra5Q8BHJ7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabra5Q8BHJ7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabra5Q8BHJ7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabra5Q8BHJ7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabra5Q8BHJ7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gabra5Q8BHJ7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gabra5Q8BHJ7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gabra5Q8BHJ7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gabra5Q8BHJ7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabra5Q8BHJ7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gabra5Q8BHJ7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabra5Q8BHJ7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabra5Q8BHJ7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabra5Q8BHJ7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabra5Q8BHJ7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gabra5Q8BHJ7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gabra5Q8BHJ7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gabra5Q8BHJ7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gabra5Q8BHJ7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gabra5Q8BHJ7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gabra5Q8BHJ7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gabra5Q8BHJ7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gabra5Q8BHJ7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gabra5Q8BHJ7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms